中國領(lǐng)銜全球**大植物基因測序 水稻育種由手工篩選走向精準(zhǔn)設(shè)計

　　迄今全球**大植物基因測序項目“3000份水稻基因組研究”26日結(jié)出碩果——北京時間當(dāng)天凌晨1點，國際****學(xué)術(shù)期刊《自然》正式發(fā)表《3010份亞洲栽培稻基因組研究》；由中國主導(dǎo)的此項國際間科研大協(xié)作，針對水稻起源、分類和馴化規(guī)律進(jìn)行了深入探討，揭示了亞洲栽培稻的起源和群體基因組變異結(jié)構(gòu)，剖析了水稻核心種質(zhì)資源的基因組遺傳多樣性。這一重大成果將推動水稻規(guī)模化基因發(fā)掘和水稻復(fù)雜性狀分子改良，提升全球水稻基因組研究和分子育種水平，使水稻育種由傳統(tǒng)的手工篩選走向基于大數(shù)據(jù)的精準(zhǔn)設(shè)計。

　　該項目首席科學(xué)家、中國農(nóng)科院作科所研究員黎志康表示，過去和未來的育種成果都取決于我們對種質(zhì)資源遺傳多樣性的利用；全球一共保留了78萬份水稻種質(zhì)資源，弄清核心種質(zhì)資源的基因組的多樣性，包括所有基因的等位基因及其各種各樣的變異，能夠為未來的水稻品種改良建立永久的、基于水稻功能基因組信息的數(shù)據(jù)庫和應(yīng)用平臺。

　　他介紹，項目經(jīng)嚴(yán)格的分層取樣法，選取源于全球89個國家的3010份水稻種質(zhì)，代表了78萬份中95%以上的遺傳多樣性。研究發(fā)現(xiàn)了

　　2900萬份新的SNPs(單核苷酸多態(tài)性)，相當(dāng)于在水稻基因組中加進(jìn)了2900萬個標(biāo)簽，給基因育種提供了精確導(dǎo)向；恢復(fù)了秈稻、粳稻的命名；完成了對栽培稻**精細(xì)的種群分類：九個群體，包括4個秈稻亞群、3個粳稻亞群及Aus、Aro；發(fā)現(xiàn)了豐富的基因組結(jié)構(gòu)變異，包括易位、倒位、重復(fù)和缺失；確定了全球首個近于完整的、高質(zhì)量的農(nóng)作物-亞洲栽培稻的泛基因組。

　　國際水稻研究所首席科學(xué)家，國際水稻基因庫主任R·S·漢密爾頓博士評價說，“過去從一個性狀發(fā)現(xiàn)到品種育成需要近40年，現(xiàn)在利用這些信息短短幾年就可以實現(xiàn)”。此外，該項研究還可以使育種過程更加高效和精確，使育成品種減少對環(huán)境的影響，低投入高產(chǎn)出，以及適應(yīng)消費者不斷變化的需求。

　　該項研究由中國農(nóng)科院作科所牽頭，聯(lián)合國際水稻研究所、華大基因、上海交大、深圳農(nóng)業(yè)基因所、安徽農(nóng)大、美國亞利桑那大學(xué)等16家機構(gòu)共同完成，并得到中國科技部、農(nóng)業(yè)農(nóng)村部、國家自然基金委及美國蓋茨基金會支持。